木吉乡行政区划上隶属于阿克陶县，阿克陶县隶属于克孜勒苏柯尔克孜自治州，克孜勒苏柯尔克孜自治州隶属于新疆维吾尔自治区，木吉乡的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于新疆维吾尔自治区。